El Departamento de Zoonosis y Vectores es el área responsable de prevenir y controlar las enfermedades transmitidas por animales y vectores.
Las enfermedades zoonóticas, son aquellas que se transmiten de un animal al hombre, ya sea por vía directa (mordedura de animal), a través de vectores (organismos vivos como insectos), o por la exposición a alimentos contaminados.
El objetivo es organizar, difundir y vigilar entre las 19 Jurisdicciones Sanitarias que conforman el Instituto de Salud del Estado de México (ISEM), las acciones para la prevención y control de estas enfermedades, como brucelosis, rabia, leptospirosis y el binomio teniosis-cisticercosis; así como reducir y mantener bajo control epidemiológico los padecimientos transmitidos por vector, como paludismo, dengue y otras arbovirosis, enfermedad de chagas, alacranismo y rickettsiosis.